「課税仕入れである」が正解。通勤手当のうち、通常必要であると認められる部分の金額は、課税仕入れとなる。なお、甲社の小売店舗の従業員に係るものであるから、個別対応方式における区分は、課税資産の譲渡等にのみ要するものに該当する。
